Program Doktor Biologi bertujuan untuk mempersiapkan mahasiswa dalam berkarir sebagai peneliti dalam ilmu biologi, dalam penerapan konsep biologi, serta pengelolaan sumber daya alam dan lingkungan tropis. Program ini didukung oleh dosen bergelar Ph.D. Kandidat yang diinginkan adalah lulusan program studi magister (S2) bidang ilmu hayati. Kandidat berlatar belakang lain akan dipertimbangkan berdasarkan kasus.